广泛的分子属性计算、过滤和操作工具。相应的相似性搜索和子结构检索,组合化学库的设计,结构活性关系的建模，最大公共子结构的查找,化学性质的计算，计算分子结构指纹,基于各种化学属性对分子结构进行分类和筛选，计算分子的各种ADMET性质，预测已知药物的代谢产物。基因表达实验的数据处理、可视化、分析、标记和报告生成等一系列功能;对序列、基因、蛋白、表达、通道和疾病信息进行整合; R统计学组件;用于回归分割模型的构建、验证和应用的各种工具。
主要分析引擎主要模块包括：
dock, homologmodeing,refinement,pharmacophores,receptor-ligand interactions,simulation,dynamic, ADMET,library design,QSAR,X-ray等。
